光电信息集成与光学制造技术湖南省重点实验室在依托单位深度开展产学院合作基础上，全面推行实验室主任负责制下的管理运行机制。即，“分工建设，责任到人；项目联动，资源共享；扬长避短，凸显特色”的管理运行模式。

实验室主任负责制就是要以实验室建设任务和目标为根本指针，实验室主任统筹发展规划、整合研发资源、统揽发展方向。 “分工负责，责任到人”是根据实验室建设发展规划和依托单位的各自地位、责任，以实验室研究方向为基础，分工合作，加强建设。即，在华南光电建设光学制造、光学测试与计量、综合光电研究室等实验分室，由华南光电技术中心负责建设管理；在湖南文理学院建设光信息与图像处理、光谱分析实验分室，由湖南文理学院物理与电子科学学院具体负责建设管理。

“项目联动，资源共享”是指实验室以项目为纽带，加大人员和资源整合力度，联合攻关，并最终形成资源共享平台。

“扬长避短，凸显特色”就是要充分发挥华南光电在技术研发、产品加工、光电检测等方面优势，着力培育光电技术和产品品牌；就是要充分发挥湖南文理学院在人才、学科和应用光电理论研究优势，为技术研发、产品开发、市场培育提供理论和技术支持，并最终形成理论研究、技术开发和产品特色。